DIA

1. 项目概述 Summary 

首先，使用等量合并后的样品作为 pool 样本进行 HPRP分级，并进行LC-MS/MS（QE-HFX_DDA 模式)分析得到DDA library 数据库。然后对各样本分别进行LC-MS/MS（DIA 模式）分析，并采用上述DDA数据库进行定性定量分析。

2. 分析流程

项目分析流程主要包括 DDA 建库与 DIA 分析两个阶段。 质谱实验分析流程主要包括蛋白质提取、肽段酶解、色谱分级、液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）DDA 数据采集、数据库检索等步骤；正式实验阶段主要包括 DIA 分析，质控分析，定性定量结果分析及生物信息学分析。见下图。

DIA 定量蛋白质组学实验流程图

3、分析内容 

实验下机数据搜库后进行生物信息学分析，分析内容主要包括鉴定分析、表达差异分析、功能分析等， 见下图。

生物信息学分析内容

样本要求

样品类型：

细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。

样品量：

①体液 全血、血清、血浆 ：2mL  

②脑脊液：6mL  

③尿液：30mL

④细胞：10*7

⑤组织：100mg

⑥蛋白提取物：100ug

保存和运输条件：

负八十长期保存，干冰运输。提取的外泌体在短时间（一周之内）使用，可以放在4度保存，如果长时间保存可以放在-80度保存。