外泌体RNA测序

外泌体RNA测序
外泌体内含有与细胞来源相关的蛋白质和核酸，可以运输蛋白质、mRNA、miRNA、lncRNA、circRNA 等进入受体细胞，参与细胞间通讯。不同细胞来源的外泌体所含有的蛋白成分和 RNA 不太相同，可作为多种疾病的早期诊断标记物，也能作为靶向药物的载体进行疾病治疗。
1）miRNA高通量分析
2）mRNA高通量分析
3）lncRNA高通量分析
4）circRNA高通量分析

小RNA测序文库采用了PE150测序方案，利用fastqc对测序文库的质量值进行评估。利用fastp进行序列两端N碱基的切除、q20过滤和adaptor切除。利用bowtie短序列比对工具比对Rfam库去除rRNA、tRNA等ncRNA，利用miRDeep2对小RNA进行定量统计，用DESeq2进行差异表达分析。

分析流程图如下所示:

样本要求

样品类型：

细胞、体液或RNA样品。其它类型样品请详询。

样品量：

①体液 全血、血清、血浆 ：5 mL  

②脑脊液：8mL  

③尿液：100 mL

④细胞上清：50ml

⑤外泌体：100ul

保存和运输条件：

负八十长期保存，干冰运输。提取的外泌体在短时间（一周之内）使用，可以放在4度保存，如果长时间保存可以放在-80度保存。